研究生部主要职责包括全院研究生思想政治教育、师资队伍建设、学位授权点建设，以及研究生招生、培养、学位、就业、学籍管理等。负责对南京分部和各培养单位研究生教育工作进行指导与监督。
一、负责研究生思想政治和学风建设，指导研究生党（团）组织、研究生会的工作。
二、负责研究生心理健康辅导，奖助体系、辅导员队伍建设等工作。
三、负责研究生导师队伍建设，组织研究生指导教师遴选、培训、监督与评价工作。
四、负责全院学位授权点申报和自主设置二级学科等动态调整工作，组织开展学科评估、学位授权点评估工作。
五、负责制定全院研究生招生计划，编制年度招生专业目录，负责招生宣传和咨询、招生考试、申请考核等工作。
六、组织制定各专业的研究生培养方案，负责院教学指导委员会办公室工作。
七、负责教师队伍建设，教学管理，教材编写，课程质量监督评价等工作，负责教学设备维护和教学场地管理。
八、负责研究生答辩资格审核，学位论文送审和抽检，以及学位论文质量评估和监督，负责院学位评定委员会办公室工作。
九、负责研究生就业宣传、咨询和指导，开展就业服务、毕业派遣等工作。
十、负责研究生教育国际、国内合作，以及研究生出国（境）管理，负责研究生实践教学基地建设和管理。
十一、负责研究生学籍、学历管理，档案管理，研究生教育宣传和信息化建设，协助负责研究生公费医疗办理和报销、保险购买和理赔等工作。
十二、承办院领导交办的其他工作。
